Для решения этого вопроса я добавил псевдоним для запуска gvim со всеми отложенными сообщениями stderr.
Просто добавьте следующую строку в ваш файл .bashrc:
alias gvim="gvim 2>/dev/null"
Я ненавижу эти типы ошибок и предупреждений, когда программа, которую я использую, находится вне моего контроля, и это печатает много из них, которые отвлекают меня от того, что я делаю.