Команды открытого терминала и вставки
sudo apt-get remove flashplugin-installer
важны для перезапуска системы перед следующим шагом.
sudo apt-get update
sudo apt-get install flashplugin-installer
Если вы не перезапустите после первой команды, работы
Мне нравится использовать Latex + (BibTex | BibLatex)
Вы также можете использовать Libreoffice + (Zotero | bibtex | ReferenceManager | Mendley, даже Endnote) Подробнее см. в библиографических ссылках для libreoffice