У меня такая же проблема на Ubuntu 14.04.
Кажется, что работает, когда я запускаю sudo modprobe -r pn533 и перезапускаю службу с помощью sudo service pcscd restart.
После исследования о том, почему мы имеем для отключения pn533, я узнаю эту ссылку из вики ArchLinux о считывателе RFID Touchatag.
Как говорится в статье, мы должны отключить драйвер pn533 и nfc в ядре с помощью
# echo "install nfc /bin/false" >> /etc/modprobe.d/blacklist.conf
# echo "install pn533 /bin/false" >> /etc/modprobe.d/blacklist.conf