Оболочка Z (zsh) имеет псевдоним на основе суффикса (-s), это позволяет вам установить ассоциацию файлов между расширением файла, например .jpg, и подходящим приложением, например xreader: [!d0 ]
alias -s pdf='xreader'
С таким псевдонимом вам просто нужно ввести имя файла и нажать ↵ Return, например:
file.pdf
Я считаю, что есть опция при установке Xubuntu, которая позволяет вам заменить текущую рабочую ОС, но не влиять на файлы в ноутбуке.