Прочтите справочные страницы оснастки

Пока у вас нет дополнительных расписаний в /etc/anacrontab, кроме ежедневных, еженедельных и ежемесячных, он должен работать из коробки, не затрагивая ничего, кроме времени выполнения ежедневных / еженедельных / ежемесячных расписаний. default crontab проверяет, установлен ли anacron, и запускает указанные графики, если отсутствует анакон в /usr/sbin/.

Чтобы быть абсолютно уверенным, вы могли бы сделать мягкое удаление, просто прекратив работу службы anacron с помощью service anacron stop и удалите test -x /usr/sbin/anacron || из строк в /etc/crontab. Когда вы будете удовлетворены, вы можете удалить пакет.