gsettings list-recursively нуждается в полном имени схемы, он не работает с именами частичной схемы. Таким образом, вы не можете использовать org.freedesktop.
Но вы можете сделать это с помощью dconf:
dconf dump /org/freedesktop/
Обратите внимание на различные обозначения здесь: dconf не использует схемы, но каталоги.