У меня была аналогичная проблема. Я делал резервную копию раздела с «Redo Backup» на USB-накопитель. Мне пришлось отменить резервное копирование, и файлы не удалось удалить. Файлы были в корзине и все еще на моем внешнем диске, но я не мог удалить ни одно из них, даже как root.
Мое решение состояло в том, чтобы загружать Windows (я все еще использую его для игр) а затем я могу удалить файлы. Возможно, загрузка с Live CD помогает, или вы подключаете USB-накопитель к другому компьютеру с другой ОС. Я знаю, что это немного хромает, но это было самое быстрое решение для меня.