Следующий python oneliner минимизирует текущее окно gnome-terminal:
python3 -c "from gi.repository import Gdk; \
[ Gdk.Screen.get_default().get_active_window().iconify() for i in range(2)]"
Обратите внимание, что для минимизации окна нам нужно вызвать iconify () два раза.