Я думаю, что последняя версия Ubuntu 15.10 может автоматически удалять старые ядра, если вы редактируете файл /etc/apt/apt.conf.d/50unattended-upgrades: Изменить строку
// Автоматическое обновление :: Remove-Unused-Dependencies "false";to
// Unattended-Upgrade :: Remove-Unused-Dependencies «false»;
Unattended-Upgrade :: Remove-Unused-Dependencies "true";