Вы, очевидно, на правильном пути, так как вы обнаружили, что изменение параметров DPI работало при запуске команды xrandr.
Раньше было легко изменить настройку DPI в самом Gnome, но, видимо, Gnome 3 сделал это трудным.
Вы можете проверить этот ответ на AskUbuntu за информацией о том, как это сделать в Gnome 3:
Как изменить шрифт Настройки DPI?