У меня была та же проблема в 11.10 и исправлена ее, перейдя в Dash Home, нажав на Интернет-приложения → Установил → Подробнее ... → Skype.
После вызова Skype оттуда он появился в боковая панель, а однажды там я нажал Dash Home . На данный момент у меня было две значки Skype на боковой панели: одна из установки, которая не работала, и только что вызывается, которая теперь работает. Я удалил первый и престо.
Я не устанавливал никаких дополнительных пакетов.
Надеюсь, это тоже поможет.