Просто обновленная версия MySQL и AppArmor, как предлагается здесь, чтобы устранить эту проблему на Ubuntu 12.04, запущенной на экземпляре Amazon ec2. Я все еще получаю ошибку несколько раз, но MySQL перезагружается автоматически.
Вместо того, чтобы пытаться использовать консольную команду fdisk, вам может понадобиться больше использовать графический инструмент GParted. Я считаю, что он позаботится о логических / расширенных флагах для вас или, по крайней мере, сделает это очевидным, что вам нужно использовать.
https://apps.ubuntu.com/cat/applications/gparted/