Выяснил проблему, может быть, что-то не так с файлами конфигурации в скрытых файлах домашней папки. Из-за какой-то другой проблемы мне пришлось очистить мою домашнюю папку и удалить все скрытые файлы, а после этого Ubuntu Tweak отлично работает со всеми доступными параметрами.