Проблема действительно кажется широко распространенной.
У меня есть точная проблема на Lenovo e540, оснащенная двойной загрузкой ubuntu gnome 16.10 / 16.04. Проблема, похоже, не существует 16.04, но это происходит 16.10. Мой Lenovo интегрировал графику Intel Haswell Mobile на Core i3-4100M и поэтому имеет графический драйвер i915.
Интересно, что у меня также есть Clevo с интегрированной графикой Intel: Core i3-3110M с Ivybridge Mobile, которая также использует тот же графический драйвер i915, запускающий Ubuntu Gnome 16.10, и на этом компьютере проблема НЕ СУЩЕСТВУЕТ.