Нажмите Alt + F2, напишите gconf-editor, он откроет gconf-editor, перейдите к destkop, gnome, периферийным устройствам, сенсорной панели и типу 2 для переменной «scroll_method». Опция останется серой, но будет разрешена прокрутка по двум пальцам. Работает для меня.