проблема с открытым MPI с использованием Ubuntu 12.04

Я обновил Ubuntu с 10.04 до 12.04 и установил open-mpi1.6.1 с сайта www.open-mpi.org, используя компилятор g95 (потому что это необходимо сделать для запуска модели загрязнения воздуха химерами). Два года назад я сделал то же самое, используя Ubuntu 10.04 и open-mpi1.4.1 без каких-либо проблем. Теперь программа всегда останавливается на:

/opt/openmpi-1.6.1-g95/bin/mpif90 -o chimere.e -I/usr/local/include -I/include -cpp -O3  -DG95 -fno-second-underscore -i4  -DMPI -ffree-form -ffree-line-length-huge \
                chimere.o integrun.o master_message_subs.o master_locvalues.o \
                chimere_common.o message_defs.o chimere_consts.o chimere_params.o \
                -L.  -linitio -ltools -lmodel -ltools -liso -L/usr/local/lib -lnetcdf -L/lib -L/opt/openmpi-1.6.1-g95/lib/

ld: chimere.o: undefined reference to symbol 'mpi_null_delete_fn_'

ld: note: 'mpi_null_delete_fn_' is defined in DSO /opt/openmpi-1.6.1-g95/lib/libmpi.so.1 so try adding it to the linker command line

/opt/openmpi-1.6.1-g95/lib/libmpi.so.1: could not read symbols: Invalid operation

make: *** [chimere] Error 1

Я установил ссылки (ln -s) библиотек open-mpi на /usr/lib и

objdump -T /usr/lib/libmpi.so.1 

indicates mpi_null_delete_fn and mpi_null_delete_fn_

http: / /pastebin.com/K08EnJAF описывает похожую проблему.

У кого-нибудь есть идеи, как решить эту проблему?

1
задан 15 September 2012 в 02:56

1 ответ

Добавьте -lmpi к вашему звонку.

Вы указали, где находится правильная библиотека, но не сказали своему компоновщику связать ее.

0
ответ дан 15 September 2012 в 02:56

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: