Поврежденные файлы

При установке чего-то я неправильно использовал команду chown (изменил разрешения практически для всех каталогов) и мне пришлось переустановить Ubuntu. До этого у меня была большая проблема с резервным копированием важных данных на внешний жесткий диск. Я почему-то думал, что мне удалось сделать это в режиме восстановления (по крайней мере, я могу видеть все данные на HD).

Однако большинство файлов каким-то образом повреждены, и я больше не могу их открыть. Кажется, они были преобразованы в какой-то двоичный формат.

Только некоторые примерные сообщения об ошибках:

opening a .png: "Fatal error reading PNG image file: Not a PNG file"

Opening .py with gedit: "The file you opened has some invalid characters...."

Странно, что:

1. Не все данные на диске повреждены.
2. Даже не все резервные копии данных повреждены, например, файлы самого высокого уровня все еще в порядке.

Кто-нибудь может мне помочь? Есть несколько действительно важных кодексов, которые я бы не хотел пропустить.