Вы могли использовать что-то как:

logging.getLogger("imported_module").setLevel(logging.WARNING)
logging.getLogger("my_own_logger_name").setLevel(logging.DEBUG)

Это установит уровень журнала моего собственного модуля для ОТЛАДКИ, препятствуя тому, чтобы импортированный модуль использовал тот же уровень.

Примечание: "imported_module" может быть заменен imported_module.__name__ (без кавычек), и "my_own_logger_name" может быть заменен __name__, если это - способ, которым Вы предпочитаете делать это.