Мои структуры IMAP и поп корректны и таким образом, ясно, что у меня есть корректный профиль. Структура данных найдена в папках ~/.thunderbird/sc3dr5b5.default/mail/local\/., например, в этом каталоге там файл для Бизнеса, Business.msf и каталога Business.sbd. И действительно что каталог содержит файл для каждого бизнеса, для которого я сохраняю почту. Проблема, они не обнаруживаются в приложении тандерберда. В Локальных Папках я вижу только Отправленный, Мусор и Ящик исходящих сообщений.
Каталог в Local \ Folders был неверным, он указывал на папку ниже этого уровня. исправить это решило мою проблему.