Если lsusb показывает ваше USB-устройство, сделайте USB-микрофон предпочтительным устройством в системных настройках.
Системные настройки> Мультимедиа> Фонон> Аудиозапись> Запись> Предпочитайте (пока не появится USB-устройство сначала)
Это сработало для меня и для Skype.