Если у вас есть мышь с 3 кнопками (или колесиком мыши с нажатием), вы можете перетащить файл / папку с нажатой 3-ей кнопкой. В качестве альтернативы, удерживайте нажатой клавишу «Alt» -Key при перетаскивании. Всплывающее меню даст вам варианты, которые вы хотите связать, переместить или скопировать.
(Это для Unity и Gnome. KDE может отличаться.)
EDIT: [ ! d2]
Я немного поиграл. Когда вы нажимаете «Shift + CTRL» во время перетаскивания, он связывает ссылку. Указатель мыши указывает, какое действие будет выполнено (маленький плюс рядом с ним означает копирование, узел для ссылки)