Все они используют dpkg в качестве бэкэнд.
Это определенно городская легенда.
Если вы хотите что-то установить из исходного кода, самый чистый способ - использовать checkinstall или установите его на /usr/local. Использование диспетчера пакетов лучше, потому что тогда удаление этого пакета намного проще.