Соответствующий файл находится сейчас:
/usr/share/unity/5/panel-shadow.png
Вы можете удалить его, вы можете переименовать его или создать резервную копию исходного изображения и использовать
Если Unity не может найти его, он не будет жаловаться (или показывать его вам).
Имейте в виду, что всякий раз, когда Unity обновляется, он заменяет файл теневого изображения, и вам придется повторить свое исправление соответствующим образом. Если вы забыли, какой файл вы изменили (или где он живет), вы можете попробовать переименовать его в нечто более запоминающееся, например annoying-panel-shadow.png. Затем вы можете просто ввести $ locate annoying и быстро найти нужную папку и файл для обновления.