У Chrome, похоже, есть ошибка, которая вызывает такое поведение - которое фиксируется в Chromium (по крайней мере, в ежедневной версии - 13.0.750.0 (83280) - что я тестировал). Исправление, в конечном счете, также поступит в Chrome.
(когда обновление приведет к фиксированному Chrome, я опубликую здесь комментарий здесь, если только я не переместился на Chromium постоянно)
Да, это нормально, что вы можете видеть ваши файлы Windows в Ubuntu, и нет, вы не можете видеть файлы Ubuntu в Windows. Windows не понимает используемую по умолчанию файловую систему Ubuntu, хотя Ubuntu понимает файловую систему Windows.