Glade не добавляет к виджетам волшебную функцию или свойства, она просто использует то, что предоставляет GTK.
Глядя на документы, я могу обнаружить, что GtkWidget имеет метод set_opacity (). Это работает только с 3,8 и является предпочтительным способом сделать это. Если ваш код также должен поддерживать GTK 3.6 и ниже, используйте GtkWindow.set_opacity ()