Вам нужно создать файл Chorme incognito.desktop, например, со следующим содержимым,
#!/usr/bin/env xdg-open
[Desktop Entry]
Version=1.0
Name=Chorme incognito
Exec=/opt/google/chrome/google-chrome --incognito
Terminal=false
Icon=google-chrome
Type=Application
Categories=Network;WebBrowser;
MimeType=text/html;text/xml;application/xhtml_xml;x-scheme-handler/http;x-scheme-handler/https;x-scheme-handler/ftp;
сохранить этот файл, открыть наутилус с правами root. (run gksu nautilus)
Перейдите к /usr/share/applications и вставьте файл здесь.
Теперь вы можете перетащить этот значок в свою пусковую установку.
Нажмите значок запуска, chorme начнется в режиме инкогнито.