У меня такое же сообщение об ошибке при перенаправлении
ln -s /usr/bin/nodejs /usr/bin/node
из node.js v0.10.25 в node.js v4.2.3, поэтому я смотрю на man ln и использую
[OPTION]
-f, --force
remove existing destination files
Это работа, как я ожидал.