~/.local/share/TpLogger/logs - путь к журналам эмпатии. Версия Empathy в Maverick использует telepathy-logger для регистрации.
Я не тестировал их восстановление, но я думаю, что имена учетных записей согласованы, поэтому они должны работать.
rsync --ignore-existing --recursive /src /dst
или вручную копируется данный каталог в другой каталог, если условия добавления * и т. д., но rsync должен сделать это.